MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Pseudomonas stutzeri DSM 10701 chromosome

Total Repeats: 96446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018177	AG	3	6	77	82	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018177	CT	3	6	91	96	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018177	GAT	2	6	113	118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018177	CTG	2	6	159	164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018177	GAGT	2	8	241	248	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018177	CGA	2	6	259	264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018177	TGA	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018177	TGA	2	6	339	344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018177	GCA	2	6	476	481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685124
10	NC_018177	GCCC	2	8	509	516	0 %	0 %	25 %	75 %	397685124
11	NC_018177	CGA	2	6	563	568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685124
12	NC_018177	CG	3	6	654	659	0 %	0 %	50 %	50 %	397685124
13	NC_018177	TCCTG	2	10	671	680	0 %	40 %	20 %	40 %	397685124
14	NC_018177	GCA	2	6	694	699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685124
15	NC_018177	CCT	2	6	706	711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397685124
16	NC_018177	CG	4	8	737	744	0 %	0 %	50 %	50 %	397685124
17	NC_018177	GAGC	2	8	779	786	25 %	0 %	50 %	25 %	397685124
18	NC_018177	GCG	2	6	798	803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685124
19	NC_018177	TACCTT	2	12	917	928	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397685124
20	NC_018177	TCG	2	6	937	942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685124
21	NC_018177	CGC	2	6	968	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685124
22	NC_018177	GGC	2	6	1029	1034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685124
23	NC_018177	ATGC	2	8	1059	1066	25 %	25 %	25 %	25 %	397685124
24	NC_018177	AGA	2	6	1087	1092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397685124
25	NC_018177	GGT	2	6	1106	1111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397685124
26	NC_018177	GCT	2	6	1208	1213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685124
27	NC_018177	CGA	2	6	1217	1222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685124
28	NC_018177	AAG	2	6	1239	1244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397685124
29	NC_018177	AGG	2	6	1255	1260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397685124
30	NC_018177	GGC	2	6	1293	1298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685124
31	NC_018177	CAG	2	6	1299	1304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685124
32	NC_018177	TTGG	2	8	1372	1379	0 %	50 %	50 %	0 %	397685124
33	NC_018177	GCC	2	6	1400	1405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685124
34	NC_018177	CG	3	6	1417	1422	0 %	0 %	50 %	50 %	397685124
35	NC_018177	TGA	2	6	1432	1437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685124
36	NC_018177	ATG	2	6	1471	1476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685124
37	NC_018177	TTC	2	6	1482	1487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397685124
38	NC_018177	TAC	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397685124
39	NC_018177	CGT	2	6	1707	1712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685124
40	NC_018177	ACCA	2	8	1767	1774	50 %	0 %	0 %	50 %	397685124
41	NC_018177	TGG	2	6	1802	1807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397685124
42	NC_018177	TGCC	2	8	1832	1839	0 %	25 %	25 %	50 %	397685124
43	NC_018177	CTG	2	6	1896	1901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685124
44	NC_018177	GACCA	2	10	1950	1959	40 %	0 %	20 %	40 %	397685125
45	NC_018177	TTG	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397685125
46	NC_018177	TGG	2	6	2005	2010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397685125
47	NC_018177	GTC	2	6	2016	2021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685125
48	NC_018177	GCG	2	6	2024	2029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685125
49	NC_018177	GACC	2	8	2096	2103	25 %	0 %	25 %	50 %	397685125
50	NC_018177	GC	3	6	2172	2177	0 %	0 %	50 %	50 %	397685125
51	NC_018177	GCCT	2	8	2200	2207	0 %	25 %	25 %	50 %	397685125
52	NC_018177	CCG	2	6	2308	2313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685125
53	NC_018177	GCTC	2	8	2329	2336	0 %	25 %	25 %	50 %	397685125
54	NC_018177	CAG	2	6	2400	2405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685125
55	NC_018177	TGC	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685125
56	NC_018177	TCA	2	6	2531	2536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397685125
57	NC_018177	CTTCAC	2	12	2648	2659	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	397685125
58	NC_018177	TGG	2	6	2668	2673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397685125
59	NC_018177	CG	3	6	2707	2712	0 %	0 %	50 %	50 %	397685125
60	NC_018177	TGG	3	9	2725	2733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397685125
61	NC_018177	GCT	2	6	2744	2749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685125
62	NC_018177	TC	3	6	2777	2782	0 %	50 %	0 %	50 %	397685125
63	NC_018177	GCT	2	6	2825	2830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685125
64	NC_018177	CAA	2	6	2843	2848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397685125
65	NC_018177	GAA	2	6	2859	2864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397685125
66	NC_018177	CTG	2	6	2931	2936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685125
67	NC_018177	TGA	2	6	2950	2955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685125
68	NC_018177	CAG	2	6	2993	2998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685125
69	NC_018177	ACG	2	6	3022	3027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685125
70	NC_018177	CGT	2	6	3038	3043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685125
71	NC_018177	TCCC	2	8	3134	3141	0 %	25 %	0 %	75 %	397685126
72	NC_018177	CGTT	2	8	3222	3229	0 %	50 %	25 %	25 %	397685126
73	NC_018177	GCA	2	6	3232	3237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685126
74	NC_018177	CGG	2	6	3301	3306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685126
75	NC_018177	GCG	2	6	3346	3351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685126
76	NC_018177	CCT	2	6	3446	3451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397685126
77	NC_018177	GGC	2	6	3602	3607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685126
78	NC_018177	GCGA	2	8	3630	3637	25 %	0 %	50 %	25 %	397685126
79	NC_018177	TAC	2	6	3738	3743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397685126
80	NC_018177	GA	3	6	3757	3762	50 %	0 %	50 %	0 %	397685126
81	NC_018177	GCC	2	6	3783	3788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685126
82	NC_018177	CAG	2	6	3897	3902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685126
83	NC_018177	TGG	2	6	3907	3912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397685126
84	NC_018177	TCG	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685126
85	NC_018177	GAC	2	6	4005	4010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685126
86	NC_018177	TG	3	6	4027	4032	0 %	50 %	50 %	0 %	397685126
87	NC_018177	TTG	2	6	4044	4049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397685126
88	NC_018177	TCA	2	6	4063	4068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397685126
89	NC_018177	GAC	2	6	4107	4112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685126
90	NC_018177	TCG	2	6	4208	4213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685127
91	NC_018177	TCGA	2	8	4328	4335	25 %	25 %	25 %	25 %	397685127
92	NC_018177	GCTG	2	8	4342	4349	0 %	25 %	50 %	25 %	397685127
93	NC_018177	GCT	2	6	4454	4459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685127
94	NC_018177	TCA	2	6	4464	4469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397685127
95	NC_018177	CGG	2	6	4486	4491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685127
96	NC_018177	CGG	2	6	4522	4527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685127
97	NC_018177	CGT	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685127
98	NC_018177	GCT	2	6	4649	4654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685127
99	NC_018177	CGG	2	6	4701	4706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685127
100	NC_018177	TCCT	2	8	4766	4773	0 %	50 %	0 %	50 %	397685127
101	NC_018177	TCC	2	6	4791	4796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397685127
102	NC_018177	TGA	2	6	4801	4806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685127
103	NC_018177	GGC	2	6	4841	4846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685127
104	NC_018177	CAA	2	6	4876	4881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397685127
105	NC_018177	GAT	2	6	4922	4927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685127
106	NC_018177	CAA	2	6	4993	4998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397685127
107	NC_018177	CTGG	2	8	5027	5034	0 %	25 %	50 %	25 %	397685127
108	NC_018177	AAG	2	6	5093	5098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397685127
109	NC_018177	CCA	2	6	5109	5114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397685127
110	NC_018177	TGA	2	6	5119	5124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685127
111	NC_018177	AGT	2	6	5293	5298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685127
112	NC_018177	GAT	2	6	5305	5310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685127
113	NC_018177	CGC	2	6	5314	5319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685127
114	NC_018177	GGC	2	6	5332	5337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685127
115	NC_018177	CGC	2	6	5360	5365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685127
116	NC_018177	GCCT	2	8	5388	5395	0 %	25 %	25 %	50 %	397685127
117	NC_018177	GAT	2	6	5563	5568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685127
118	NC_018177	CTC	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397685127
119	NC_018177	ACA	2	6	5631	5636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397685127
120	NC_018177	CAT	4	12	5659	5670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397685127
121	NC_018177	CTT	3	9	5719	5727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397685127
122	NC_018177	GCC	2	6	5776	5781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685127
123	NC_018177	GAC	2	6	5825	5830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685127
124	NC_018177	AGC	2	6	5925	5930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685127
125	NC_018177	TACCG	2	10	5942	5951	20 %	20 %	20 %	40 %	397685127
126	NC_018177	ATCT	2	8	6011	6018	25 %	50 %	0 %	25 %	397685127
127	NC_018177	CG	3	6	6021	6026	0 %	0 %	50 %	50 %	397685127
128	NC_018177	AGC	2	6	6036	6041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685127
129	NC_018177	CTGG	2	8	6067	6074	0 %	25 %	50 %	25 %	397685127
130	NC_018177	GAA	2	6	6094	6099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397685127
131	NC_018177	TTC	2	6	6224	6229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397685127
132	NC_018177	TCT	2	6	6280	6285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397685127
133	NC_018177	CCT	2	6	6333	6338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397685127
134	NC_018177	CAAG	2	8	6340	6347	50 %	0 %	25 %	25 %	397685127
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139	NC_018177	TTTC	2	8	6689	6696	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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166	NC_018177	ATC	2	6	7788	7793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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266	NC_018177	TTG	2	6	12279	12284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397685130
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268	NC_018177	CGC	2	6	12299	12304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397685130
269	NC_018177	GTA	2	6	12323	12328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397685130
270	NC_018177	GCT	2	6	12329	12334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685130
271	NC_018177	TCG	2	6	12342	12347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685130
272	NC_018177	CAT	2	6	12425	12430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397685130
273	NC_018177	TCA	2	6	12481	12486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397685130
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275	NC_018177	GGC	2	6	12595	12600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685130
276	NC_018177	GCA	2	6	12607	12612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685130
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279	NC_018177	GCA	2	6	12714	12719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685131
280	NC_018177	CTG	2	6	12730	12735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685131
281	NC_018177	CG	3	6	12754	12759	0 %	0 %	50 %	50 %	397685131
282	NC_018177	GCG	2	6	12780	12785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685131
283	NC_018177	CGAA	2	8	12807	12814	50 %	0 %	25 %	25 %	397685131
284	NC_018177	TGCG	2	8	12862	12869	0 %	25 %	50 %	25 %	397685131
285	NC_018177	GCA	2	6	12870	12875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397685131
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288	NC_018177	TCG	2	6	13076	13081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685131
289	NC_018177	CTT	2	6	13108	13113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397685131
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300	NC_018177	GC	3	6	13460	13465	0 %	0 %	50 %	50 %	397685131
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334	NC_018177	TGG	2	6	15189	15194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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381	NC_018177	GTC	2	6	17892	17897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397685134
382	NC_018177	TTG	2	6	17915	17920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
383	NC_018177	GGCT	2	8	17949	17956	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
384	NC_018177	TTG	2	6	17970	17975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
385	NC_018177	AGAA	2	8	18000	18007	75 %	0 %	25 %	0 %	397685135
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389	NC_018177	CGG	2	6	18300	18305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397685135
390	NC_018177	AAGC	2	8	18317	18324	50 %	0 %	25 %	25 %	397685135
391	NC_018177	GCTG	2	8	18362	18369	0 %	25 %	50 %	25 %	397685135
392	NC_018177	TCAT	2	8	18396	18403	25 %	50 %	0 %	25 %	397685135
393	NC_018177	GAG	2	6	18414	18419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397685135
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